从色雷斯国找到了自己的过去的法伊，一行人在黑钢牺牲了一只手臂的情况下，仍然没有躲过飞王的陷井，来到了“日本国”。在日本国，小狼为了小樱的羽毛和星史郎起了激烈的冲突。就在这场激烈的战斗中，小狼被羽毛引导着来到了“梦之世界”，在这里等待着小狼的是—另一个小狼？！无法避开的战斗的最终将迎来什么样的冲击性的真实？！……

从色雷斯国找到了自己的过去的法伊，一行人在黑钢牺牲了一只手臂的情况下，仍然没有躲过飞王的陷阱，来到了“日本国”。在日本国，小狼为了小樱的羽毛和星史郎起了激烈的冲突。就在这场激烈的战斗中，小狼被羽毛引导着来到了“梦之世界”，在这里等待着小狼的是—另一个小狼？！无法避开的战斗的最终将迎来什么样的冲击性的真实？！……

法伊在色雷斯国寻回了自己的过往，一行人即便付出了黑钢失去一只手臂的代价，还是没能躲开飞王设下的陷阱，来到了“日本国”。在日本国，小狼因小樱的羽毛与星史郎爆发了激烈冲突。在这场激战中，小狼被羽毛引至“梦之世界”，而在此等候着他的竟是——另一个小狼？！这场无法回避的战斗，最终会揭开怎样具有冲击性的真相呢？

在沙漠城市玖楼国，少年小狼多年前，跟随养父考古家藤隆来到这国家，希望发掘该国的翼形遗迹，以解开玖楼国的历史之谜。小狼因此认识了玖楼国中的各人，包括与他青梅竹马的小樱公主。二人一直互相心仪，但小狼碍于身份问题，一直不敢表白。藤隆辞世后，小狼继承父亲遗志，继续挖掘和研究工作。为了拯救小樱，小狼带着小樱与新结识的法伊和黑钢踏上了在不同次元甚至不同时间寻找羽毛的征程，而飞王也在密切关注着事情的进展。只是主人公四人不会想到，这一切的一切，都是一个巨大的阴谋。

从色雷斯国找到了自己的过去的法伊，一行人在黑钢牺牲了一只手臂的情况下，仍然没有躲过飞王的陷阱，来到了“日本国”。在日本国，小狼为了小樱的羽毛和星史郎起了激烈的冲突。就在这场激烈的战斗中，小狼被羽毛引导着来到了“梦之世界”，在这里等待着小狼的是另一个小狼？！无法避开的战斗的最终将迎来什么样的冲击性的真实？！……

羽翼年代记第二季故事讲述玖楼国的公主小樱拥有跨越时空的能力，和她在一起的小狼则是一个继承父亲遗志的考古家。英俊的小狼充满正义，勇敢刚强。把小樱视为生命里最重要的人。他们遭到不明身份的野心家狙击。小樱因此失去了全部记忆，而且伤重昏迷。小狼为了寻找小樱的“记忆之羽”而穿梭在不同的时空。和另外两个目的不同的旅伴--黑钢及法依一起踏上了奇异的魔法之旅！

樱一行人在法伊的魔法帮助下来到一个新的国度——东京，这里一片荒凉废墟，经常下酸雨，人们为了水而争战，这个地区只有两个地方有水，一个是都厅，一个是东京铁塔，双方对立。 一行人和神威一方在一起，樱陷入沉睡中，灵魂和躯体分开，到了都厅的水下的羽毛织成的茧中，听到了同样在茧中的昴流对她的呼唤；“快醒醒，再不醒就来不及了，你最重要的人就要离你而去了”

为了拯救失去了全部记忆的爱人小樱，小狼抱着必死的决心来到了次元的魔女那里。 魔女告诉了能救小樱唯一的办法就是找回所有飞散到异世 界的小樱的记忆的羽毛。 为了实现小狼的愿望需要对价，魔女要求的对价就是小狼与小樱的关系性。 来自异次元的忍者黑钢、魔术师法伊以及 作为向导的莫可拿，与小狼一起踏上了去往异世界的旅程。 根据来自次元的魔女侑子那里的莫可拿的指引，小狼和小樱来到'鸟笼国”的故事 开始了。 那里本是一个人们同鸟一起相伴生活的和平的国家。 但是，由于如今国王的压制，叛逆者的鸟被夺走并被强制过上了悲惨的生活。 国王用不可思议的羽毛的力量支配着国民。 他所拥有的的确就是小樱的记忆吗?与黑钢、法伊分开，落进了茂密的森林里……

隐藏着神秘力量的玖楼国的公主·小樱，在某一天，中了某人的诡计，失去了记忆。为了取回她变成“羽毛”而飞散到异世界的记忆，她的青梅竹马小狼展开了冒险之旅。他所到达的是……

隐藏着神秘力量的玖楼国的公主·小樱，在某一天，中了某人的诡计，失去了记忆。为了取回她变成“羽毛”而飞散到异世界的记忆，她的青梅竹马小狼展开了冒险之旅。他所到达的是……